ABCIでSingularityイメージファイルを作成するには
投稿:hagi
Singularity PRO 3.5環境で、fakerootオプションを使用することにより、buildを使ったイメージを作成できます。
例）Singularityイメージ作成
[username@es1 ~]$ module load singularitypro/3.5 [username@es1 ~]$ singularity build --fakeroot ubuntu.sif ubuntu.def INFO: Starting build... (snip) INFO: Creating SIF file... INFO: Build complete: ubuntu.sif [username@es1 singularity]$
例）グループ領域(/groups1, /groups2)で、Singularityイメージ作成を作成する場合
上記コマンドをグループ領域(/groups1, /groups2)配下で実行するとエラーが発生します。その場合、singularityコマンドを実行する前に以下のようにid -aコマンドで所属するグループを確認の上、newgrpコマンドを実施いただくことで回避可能です。
下記例のgaa00000の箇所が所属するグループとなります。
[username@es1 groupname]$ id -a uid=0000(aaa00000aa) gid=0000(aaa00000aa) groups=0000(aaa00000aa),00000(gaa00000) [username@es1 groupname]$ newgrp gaa00000
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